MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE01

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010715	AT	3	6	4972	4977	50 %	50 %	0 %	0 %	188584628
2	NC_010715	CTT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
3	NC_010715	CCA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584628
4	NC_010715	T	7	7	5009	5015	0 %	100 %	0 %	0 %	188584628
5	NC_010715	AGC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584628
6	NC_010715	CTTT	2	8	5078	5085	0 %	75 %	0 %	25 %	188584628
7	NC_010715	T	6	6	5083	5088	0 %	100 %	0 %	0 %	188584628
8	NC_010715	TAT	3	9	5093	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584628
9	NC_010715	CTT	2	6	5114	5119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
10	NC_010715	TCT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584628
11	NC_010715	CTTT	2	8	5178	5185	0 %	75 %	0 %	25 %	188584628
12	NC_010715	TCT	2	6	5299	5304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584629
13	NC_010715	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584629
14	NC_010715	ATT	2	6	5354	5359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584629
15	NC_010715	GCT	2	6	5372	5377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584629
16	NC_010715	TAG	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584629
17	NC_010715	T	6	6	5431	5436	0 %	100 %	0 %	0 %	188584629
18	NC_010715	ACA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584629
19	NC_010715	GGT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584629
20	NC_010715	TA	3	6	5578	5583	50 %	50 %	0 %	0 %	188584629
21	NC_010715	TAA	2	6	5620	5625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584629
22	NC_010715	A	6	6	5678	5683	100 %	0 %	0 %	0 %	188584629
23	NC_010715	CAG	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584629
24	NC_010715	TTG	2	6	5794	5799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584629
25	NC_010715	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584629
26	NC_010715	TA	3	6	5869	5874	50 %	50 %	0 %	0 %	188584629
27	NC_010715	CTC	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584629
28	NC_010715	GTA	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584629
29	NC_010715	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
30	NC_010715	TTG	2	6	6250	6255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584630
31	NC_010715	GAT	2	6	6381	6386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
32	NC_010715	GTG	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584630
33	NC_010715	TAT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584630
34	NC_010715	G	6	6	6438	6443	0 %	0 %	100 %	0 %	188584630
35	NC_010715	TGA	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
36	NC_010715	GAG	3	9	6498	6506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188584630
37	NC_010715	A	6	6	6507	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	188584630
38	NC_010715	AGA	2	6	6548	6553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
39	NC_010715	AGA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584630
40	NC_010715	T	6	6	6579	6584	0 %	100 %	0 %	0 %	188584630
41	NC_010715	GAT	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584630
42	NC_010715	TGG	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584630
43	NC_010715	TAA	2	6	6615	6620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584630
44	NC_010715	A	8	8	6853	6860	100 %	0 %	0 %	0 %	188584631
45	NC_010715	CAC	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584631
46	NC_010715	GTT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584631
47	NC_010715	TAT	2	6	7598	7603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
48	NC_010715	TTTG	2	8	7643	7650	0 %	75 %	25 %	0 %	188584632
49	NC_010715	CTTTCA	2	12	7741	7752	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188584632
50	NC_010715	CAG	2	6	7864	7869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584632
51	NC_010715	TTTC	2	8	7943	7950	0 %	75 %	0 %	25 %	188584632
52	NC_010715	TTC	2	6	7967	7972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
53	NC_010715	AAT	2	6	8008	8013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584632
54	NC_010715	T	6	6	8039	8044	0 %	100 %	0 %	0 %	188584632
55	NC_010715	TTTC	2	8	8065	8072	0 %	75 %	0 %	25 %	188584632
56	NC_010715	AT	3	6	8105	8110	50 %	50 %	0 %	0 %	188584632
57	NC_010715	TAC	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
58	NC_010715	GTT	2	6	8128	8133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584632
59	NC_010715	TA	3	6	8213	8218	50 %	50 %	0 %	0 %	188584632
60	NC_010715	GAA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584632
61	NC_010715	TAC	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
62	NC_010715	TCT	2	6	8367	8372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
63	NC_010715	TGA	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584632
64	NC_010715	AT	3	6	8394	8399	50 %	50 %	0 %	0 %	188584632
65	NC_010715	TTTC	2	8	8401	8408	0 %	75 %	0 %	25 %	188584632
66	NC_010715	CATT	2	8	8421	8428	25 %	50 %	0 %	25 %	188584632
67	NC_010715	TAT	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
68	NC_010715	AAC	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584632
69	NC_010715	TA	3	6	8669	8674	50 %	50 %	0 %	0 %	188584632
70	NC_010715	TC	3	6	8676	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	188584632
71	NC_010715	A	7	7	8705	8711	100 %	0 %	0 %	0 %	188584632
72	NC_010715	CTT	2	6	8731	8736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
73	NC_010715	T	6	6	8803	8808	0 %	100 %	0 %	0 %	188584632
74	NC_010715	TCTT	2	8	8823	8830	0 %	75 %	0 %	25 %	188584632
75	NC_010715	TAGGTT	2	12	8836	8847	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	188584632
76	NC_010715	AGC	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584632
77	NC_010715	TCT	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
78	NC_010715	CTC	2	6	9079	9084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584632
79	NC_010715	TAT	2	6	9098	9103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584632
80	NC_010715	T	6	6	9123	9128	0 %	100 %	0 %	0 %	188584632
81	NC_010715	T	8	8	9147	9154	0 %	100 %	0 %	0 %	188584632
82	NC_010715	TTC	2	6	9164	9169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584632
83	NC_010715	ATC	2	6	9173	9178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584632
84	NC_010715	T	6	6	9368	9373	0 %	100 %	0 %	0 %	188584632
85	NC_010715	CTG	2	6	9482	9487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584632
86	NC_010715	T	7	7	9747	9753	0 %	100 %	0 %	0 %	188584633
87	NC_010715	CAT	2	6	9935	9940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584633
88	NC_010715	CAT	2	6	9943	9948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584633
89	NC_010715	TCT	3	9	9963	9971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584633
90	NC_010715	T	6	6	10019	10024	0 %	100 %	0 %	0 %	188584633
91	NC_010715	TC	3	6	10062	10067	0 %	50 %	0 %	50 %	188584633
92	NC_010715	T	7	7	10173	10179	0 %	100 %	0 %	0 %	188584633
93	NC_010715	AAC	2	6	10182	10187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584633
94	NC_010715	TAT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584634
95	NC_010715	T	7	7	10354	10360	0 %	100 %	0 %	0 %	188584634
96	NC_010715	CCA	2	6	10361	10366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584634
97	NC_010715	TTTCA	2	10	10382	10391	20 %	60 %	0 %	20 %	188584634
98	NC_010715	TTGTT	2	10	10408	10417	0 %	80 %	20 %	0 %	188584634
99	NC_010715	T	6	6	10421	10426	0 %	100 %	0 %	0 %	188584634
100	NC_010715	TCT	2	6	10449	10454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
101	NC_010715	T	6	6	10461	10466	0 %	100 %	0 %	0 %	188584634
102	NC_010715	T	6	6	10471	10476	0 %	100 %	0 %	0 %	188584634
103	NC_010715	GAT	2	6	10477	10482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584634
104	NC_010715	GTT	2	6	10510	10515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584634
105	NC_010715	CTT	2	6	10516	10521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
106	NC_010715	TTC	2	6	10541	10546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584634
107	NC_010715	T	6	6	10571	10576	0 %	100 %	0 %	0 %	188584634
108	NC_010715	A	6	6	10601	10606	100 %	0 %	0 %	0 %	188584634
109	NC_010715	T	6	6	10616	10621	0 %	100 %	0 %	0 %	188584634
110	NC_010715	CCAT	2	8	10623	10630	25 %	25 %	0 %	50 %	188584634
111	NC_010715	CAAC	2	8	10660	10667	50 %	0 %	0 %	50 %	188584634
112	NC_010715	CGT	2	6	10678	10683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584634
113	NC_010715	AT	3	6	10776	10781	50 %	50 %	0 %	0 %	188584634
114	NC_010715	TA	3	6	10805	10810	50 %	50 %	0 %	0 %	188584634
115	NC_010715	T	6	6	10861	10866	0 %	100 %	0 %	0 %	188584634
116	NC_010715	TCC	2	6	10893	10898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584634
117	NC_010715	TCACC	2	10	10903	10912	20 %	20 %	0 %	60 %	188584634
118	NC_010715	AAT	2	6	11007	11012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584635
119	NC_010715	T	6	6	11039	11044	0 %	100 %	0 %	0 %	188584635
120	NC_010715	T	6	6	11049	11054	0 %	100 %	0 %	0 %	188584635
121	NC_010715	T	6	6	11070	11075	0 %	100 %	0 %	0 %	188584635
122	NC_010715	TTC	2	6	11084	11089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584635
123	NC_010715	GTT	2	6	11115	11120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584635
124	NC_010715	AGC	2	6	11123	11128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584635
125	NC_010715	AGA	2	6	11155	11160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584635
126	NC_010715	T	6	6	11166	11171	0 %	100 %	0 %	0 %	188584635
127	NC_010715	TAT	2	6	11244	11249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584635
128	NC_010715	CTT	2	6	11451	11456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584635
129	NC_010715	TCAT	2	8	11474	11481	25 %	50 %	0 %	25 %	188584635
130	NC_010715	GTA	2	6	11590	11595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584636
131	NC_010715	TCT	2	6	11631	11636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584636
132	NC_010715	TCTTT	2	10	11679	11688	0 %	80 %	0 %	20 %	188584636
133	NC_010715	TGC	2	6	11731	11736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584636
134	NC_010715	TTG	2	6	11793	11798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584636
135	NC_010715	T	6	6	11890	11895	0 %	100 %	0 %	0 %	188584636
136	NC_010715	CT	3	6	11912	11917	0 %	50 %	0 %	50 %	188584636
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144	NC_010715	TGA	2	6	12278	12283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584636
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.